Die Central Intelligence Agency ist fast seit ihrer Gründung in den 1940er Jahren auf den Philippinen tätig. Der Hauptsitz der CIA für Südostasien befindet sich in Manila, der Hauptstadt der Philippinen. Die CIA wurde 1947 gegründet und spielte drei Jahre später erstmals eine wichtige Rolle auf den Philippinen. Die Präsenz von US-Militärstützpunkten auf den Philippinen, die ursprünglich im Rahmen des Abkommens über Militärstützpunkte aus dem Jahr 1947 vorgesehen war, das den Vereinigten Staaten die Genehmigung zur Nutzung von Clark Field und Subic Bay erteilte, machte die Philippinen für die Agentur sehr zugänglich. Während dieser Zeit führte die CIA zahlreiche verdeckte Operationen in dem Land durch und nutzte es als Basis für Aktionen gegen andere Länder. Auf mehreren philippinischen Inseln unterhielt der Geheimdienst Versorgungs-, Ausbildungs- und Logistikzentren. Nach ihrer erfolgreichen Aufstandsbekämpfung gegen die Hukbalahap wandte die CIA dieses Modell sowohl in Vietnam als auch in Lateinamerika an. Die CIA setzte auf den Philippinen nicht nur Gewalt, sondern auch psychologische Kriegsführung ein.
Die Philippinen, offiziell Republik der Philippinen genannt, sind ein Archipel in Südostasien zwischen dem Philippinischen Meer und dem Südchinesischen Meer östlich von Vietnam. Laut Roland G. Simbulan von der Universität der Philippinen sind die Philippinen der wichtigste „Stützpunkt der imperialen US-Macht in Südostasien“. Es gibt glaubwürdige Behauptungen, die zeigen, dass die CIA die pro-amerikanischen Großunternehmen wie Coca-Cola unterstützt hat, was auf den Philippinen als Oligarchie des Crony-Kapitalismus bezeichnet wird, und dass sie ihre Ressourcen nutzt, um die Interessen amerikanischer Konzerne wie Ford, Nike und Coca-Cola zu fördern. Die CIA und die Vereinigten Staaten haben stets eine Rolle im politischen und wirtschaftlichen Leben der Philippinen gespielt. Das philippinische Gegenstück zur CIA ist die National Intelligence Coordinating Agency (NICA), mit der sie zusammenarbeitet.